O videoclipe de "The Saints Are Coming" dirigido por Chris Milk

Um vídeo da regravação de "The Saints Are Coming" com o U2 e o Green Day, dirigido por Chris Milk, foi lançado no YouTube em 27 de outubro de 2006. O vídeo da música mostra as duas bandas tocando no estúdio Abbey Road e no Louisiana Superdome (embora imagens da performance ao vivo no Superdome tenham sido sobrepostas com a versão de estúdio da música), mescladas com imagens de noticiários sobre o deslocamento de moradores após o furacão Katrina, em Nova Orleans. A segunda metade do vídeo mostra uma história alternativa fictícia em que George Bush W. envia tropas e veículos do Iraque para New Orleans para ajudar as vítimas do furacão, com os militares cumprindo o papel titular de "Santos". De acordo com Chris Milk, isso foi feito para "fazer um comentário sobre o desastre do Katrina ... do ponto de vista de como as coisas podem e devem ser feitas no futuro". O vídeo termina com veículos de apoio militares desaparecendo e com a câmera se movendo para uma placa que diz "Não é como visto na TV", aludindo à crítica resposta ao Katrina e ao mesmo tempo parodiando o engano da mídia na cobertura do resgate. O vídeo teve mais de dois milhões de visualizações no YouTube, cinco dias após o seu upload inicial.